L'UCAD compte 7 Ecoles doctorales :
- Arts, Cultures et Civilisations (ARVIC)
- Eau, Qualité et Usages de l'Eau (EQUE)
- Etudes de l'Homme et de la Société (ETHOS)
- Mathématiques Informatiques (MI)
- Physiques, Chimie, Sciences de la Terre, de l'Univers et de l'Ingénieur (PCSTUI)
- Sciences de la Vie, de la Santé et de l'Environnement (SEV)
- Sciences Juridiques, Politiques, Economiques et de Gestion (JPEG)