L'UCAD compte onze (11) Instituts de Faculté :
- Centre de Recherche, d'Études et de Documentation sur les Institutions et la Législation Africaines (CREDILA) à la Faculté des Sciences Juridiques et Politiques
- Centre de Recherches Économiques Appliquées (CREA) à la Faculté des Sciences Economiques et de Gestion
- Centre de Recherche en Gestion des Entreprises (CREGE) à la Faculté des Sciences Economiques et de Gestion
- Centre de Recherches et de Formation en Développement Économique et Social (CREFDES) à la Faculté des Sciences Economiques et de Gestion
- Institut de Formation en Administration et en Création d’Entreprises (IFACE) à la Faculté des Sciences Economiques et de Gestion
- Institut des Sciences de l'Environnement (ISE) à la Faculté des Sciences et Techniques
- Centre des Hautes Études afro-ibéro-américaines à la Faculté des Lettres et Sciences Humaines
- Institut des Langues Étrangères Appliquées (ILEA) à la Faculté des Lettres et Sciences Humaines
- Institut du Cancer à la Faculté de Médecine, de Pharmacie et d'Odontostomatologie
- Institut des métiers du Droit (IMD) à la FSJP
- Institut supérieur de l’Agriculture et de l’entreprenariat (ISAE) à la FST