L'UCAD compte 7 Ecoles doctorales :

1. Arts, Cultures et Civilisations (ARVIC)
2. Eau, Qualité et Usages de l'Eau (EQUE)
3. Etudes de l'Homme et de la Société (ETHOS)
4. Mathématiques Informatiques (MI)
5. Physiques, Chimie, Sciences de la Terre, de l'Univers et de l'Ingénieur (PCSTUI)
6. Sciences de la Vie, de la Santé et de l'Environnement (SEV)
7. Sciences Juridiques, Politiques, Economiques et de Gestion (JPEG)